转移，但仍有少数主要据点还在日军手里，如新不列颠岛东北的拉包尔。
麦克阿瑟调部队北上菲律宾时间，新几内亚岛岛上残余的日军在两万人左右，只不过全部躲进了深山密林，缺少补给和援助，虽然也翻不起什么大浪，但仍需要有部队去进行清理，这个任务就落在以澳军为主的其他盟军身上，包括缅甸军队。
现在麦克阿瑟又调走了两个师的其他国部队上前线，将澳军仍然留在巴布亚新几内亚岛上。等于是美军和其他盟军吃肉，享受胜利的欢呼，澳军则在后面喝汤，不引人注意且也没有任何声誉，这自然让他们不满。
为此，澳军司令官托马斯·布莱梅将军不得不亲自向麦克阿瑟写信，希望对方也能够将澳大利亚军队调到菲律宾战场去。
原时空历史上麦克阿瑟最后确实是答应了布莱梅将军的要求，在四五年时曾让澳军单独进攻了加里曼丹岛。可现在不一样了，加里曼丹岛上已经有了抗日武装，且都宣布独立，岛上的日军也就万人不到，对美军的威胁根本就没有。
其次，麦克阿瑟可还记得这位澳大利亚军队总司令对自己的不待见和不服从。作为爱出风头的麦帅，怎么可能会容忍这种事发生。之前不报复是因为权力不够，现在手握重兵后自然得还回来。
麦克阿瑟和托马斯·布莱梅将军的个人恩怨还得从他从菲律宾退到澳大利亚时说起。
麦克阿瑟败退澳大利亚不久，在欧洲的托马斯·布莱梅也被调回澳大利亚，任澳大利亚集团军司令，随后又被任命为西南太平洋战区盟军地面部队司令，这一地位比当时的麦克阿瑟还要高。
对此，野心勃勃和争强好胜的麦克阿瑟自然内心不高兴，可那个时候美军还没有开始大规模调往澳大利亚，在澳洲的澳军数量远超美军，麦克阿瑟只能忍气吞声，屈服于布莱梅的指挥。
但后来美军陆续调来，数量上远远超过了澳军，随后麦克阿瑟也被罗斯福总统正式任命为西南太平洋战区统帅，开始有说话的权利，便与布莱梅争权夺利。几次争斗下来，布莱梅的盟国地面部队司令部便成虚设了。
